Hämtat från en blogg - ingen koll på sanningshalten 
Om jag minns rätt så härstammar det från tiden då pesten härjade i Europa. Ett av symtomen till att man hade sjukdomen var att man nös. Det var då man började säga "prosit" som på latin betyder något i stil med "må gud vara med dig" eller "må det gagna".
Antar att det är därför man i USA säger "God bless you". Undrar om amerikanarna vet varför man säger så. Deras uttryck är åtminstone på deras språk.
En annan åsikt:
Enligt gammal folktro hade man en föreställning om att onda andar flyger in och ut när man nyser. Genom att säga prosit, som betyder något i stil med "må det gynna dig", önskade man istället att goda andar skulle flyga in.
Och efter detta ska jag sluta spamma denna tråd 
När någon nyser säger man ofta prosit. Ordet kommer från latinet och betyder ungefär "må det gagna". Motsvarande uttryck finns i många andra språk. Mest kända är nog engelskans "God bless you" och tyskans "Gesundheit". I Sverige användes tidigare "gusinne", alltså Gud signe. Man åkallade Gud i tron att den okontrollerade nysningen var onda makters verk. Prosit har troligen använts i svenskan sedan 1700-talet.
Micke