I det andra alternativet skulle jag nog säga "då måste allt klicka". När det används i den positiva bemärkelsen så tänker jag mig att liknelsen är med kugghjul som klickar i varandra perfekt. Ingen aning om ifall det är den ursprungliga förklaringen.
Nu när jag läst vad andra skrivit så skulle jag nog egentligen använda ordet "klaffa". Men "klicka" låter inte fel, så jag skulle kunna säga det också. Kanske är det för att orden låter lika som de används på samma sätt.
Jag håller med om att ett vapen som klickar är något negativt, dvs man lyckades inte skjuta.