Padirac skrev 2022-02-02 17:12:00 följande:
"Figur 10 visar tre möjliga scenarion för hur 20C:G24368T-varianten kan ha nått Sverige: A) Varianten uppstod i Österrike och exporterades därifrån till Sverige och andra länder; B) Varianten uppstod i Österrike, men nådde Sverige via ett annat land; C) Varianten uppstod i Sverige och spreds därifrån till andra länder. Vi bedömer att det troligaste scenariot är att 20C:G24368T-varianten uppstod i österrikiska alperna eftersom denna region utgjorde ett nav för superspridning av genotyp 20C vid månadsskiftet februari?mars 2020 [17]. Det som också talar för detta scenario är att 20C:G24368T-varianten nästintill samtidigt påvisades i Sverige, Storbritannien, Danmark och Norge, varifrån sannolikt många skidturister befann sig i Ischgl och andra orter i Tyrolen. Det som talar emot scenariot är att varianten inte påvisats i prover från Österrike och att Österrike inte finns angivet för smittland för några av de tidiga 20C:G24368T-fallen. Antalet sekvenser av genotypen 20C från Österrike från veckorna 10?12 är dock lågt (1, 51 och 33 sekvenser i respektive vecka), vilket kan jämföras med drygt 300 20C-sekvenser från Danmark i veckorna 10?11. Ett lågt antal sekvenserade prov i Österrike kan således vara en orsak till att varianten 20C:G24368T inte har påvisats där. I detta sammanhang kan noteras att de österrikiska sekvenserna av genotyp 20C från vecka 11 uppvisar genetisk diversitet med sekvenser som skiljer sig med en, två respektive tre mutationer från grundvarianten av 20C. Denna diversitet indikerar dels att 20C- spridningen vid denna tid pågått ett par veckor i Österrike och dels att det troligen fanns ytterligare varianter som cirkulerade där men inte återfinns bland de få tillgängliga österrikiska sekvenserna. Motsvarande situation finns för varianterna 20A:G22583A och 20A:A12790G som med stor säkerhet importerades till Sverige från Italien, men ändå saknas bland sekvenser från Italien (se nedan). Scenario B (smitta till Sverige via ett annat land än Österrike) bedömer vi mindre sannolikt eftersom det förutsätter att varianten redan hunnit etablera sig i detta tredje land och spridas till Sverige till slutet av vecka 10. På samma sätt bedömer vi scenario C (varianten uppstod i Sverige) mindre sannolikt eftersom den påvisades i Danmark och England nästan samtidigt som i Sverige. Vi har övervägt att matematiskt modellera sannolikheten för dessa alternativa scenarion, men har avstått eftersom flera viktiga parametervärden är väldigt osäkra.
Vår bedömning om ett troligt österrikiskt ursprung för 20C:G24368T-varianten skiljer sig från rapporter från Folkhälsomyndigheten [18] och Danmark [15] där man föreslår att varianten importerats från andra länder i Europa respektive Storbritannien, vilket vi finner mindre sannolikt, men inte uteslutet, givet ovanstående resonemang."
Figur 10: Alternativa scenarion för spridningen av 20C:G24368T-varianten. A) Mutationen G24368T uppstår i alpområdet men detekteras inte där. Varianten 20C:G24368T sprids därifrån till Sverige och andra länder, bland annat Danmark och Storbritannien. Från Sverige sprids den senare vidare till Finland. B) Mutationen G24368T uppstår i alpområdet men detekteras inte där. Varianten 20C:G24368T sprids till andra länder, bland annat Danmark och Storbritannien, varifrån den vidare sprids till Sverige. Från Sverige sprids den senare vidare till Finland. C) Genotypen 20C importeras till Sverige från alpområdet. Mutationen G24368T uppstår i Sverige varifrån den sprids vidare till andra länder, bland annat Danmark, Storbritannien och Finland.
Tack, jag har läst det ganska noga nu. Men antigen så är det för krångligt för mig eller så är det inte riktigt säkert? Är det inte så att man egentligen inte kan vara säker? Det man skulle vilja se vore smittspårningen på dem personerna som varit i alperna. Då skulle man kunna se om smittan som kom ifrån dem slutade någonstans, eller om det spridde sig och ökade därifrån.
De olika typerna av mutationer gör det hela väldigt krångligt.